MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 8479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017545	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017545	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017545	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017545	G	7	7	306	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017545	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017545	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017545	T	6	6	1804	1809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017545	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017545	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017545	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017545	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017545	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017545	T	7	7	4504	4510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017545	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017545	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_017545	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017545	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017545	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017545	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017545	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017545	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017545	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017545	T	7	7	10643	10649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017545	A	6	6	10656	10661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017545	A	6	6	10706	10711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017545	A	7	7	12823	12829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017545	TAA	2	6	12836	12841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017545	A	6	6	12852	12857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017545	TAT	2	6	12886	12891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017545	AGT	2	6	15881	15886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017545	T	7	7	15911	15917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017545	AT	3	6	15976	15981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017545	A	6	6	16064	16069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017545	T	7	7	16079	16085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017545	T	6	6	16109	16114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017545	CTT	2	6	16139	16144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017545	G	6	6	17329	17334	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017545	CTC	2	6	21432	21437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017545	T	6	6	21500	21505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017545	A	7	7	21562	21568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017545	ATT	2	6	21574	21579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017545	GAG	2	6	21636	21641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017545	TCA	2	6	23106	23111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017545	GAAAA	2	10	24005	24014	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017545	A	6	6	24121	24126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017545	CG	3	6	24165	24170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017545	AAG	2	6	25845	25850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017545	GGA	2	6	27480	27485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017545	T	6	6	28236	28241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017545	AAAT	2	8	28904	28911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017545	A	7	7	28919	28925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017545	AT	3	6	28951	28956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017545	TCA	2	6	28962	28967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017545	A	6	6	29068	29073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017545	AGGA	2	8	29082	29089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017545	GTC	2	6	29091	29096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017545	TAAA	2	8	31011	31018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017545	TCC	2	6	33358	33363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017545	AAAGG	2	10	35584	35593	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017545	CTT	2	6	36099	36104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017545	AT	3	6	36110	36115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017545	T	6	6	36142	36147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017545	ATC	2	6	36180	36185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017545	AAT	2	6	36212	36217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017545	T	6	6	36242	36247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017545	A	6	6	36280	36285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017545	A	7	7	36640	36646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017545	T	6	6	36665	36670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017545	CCTT	2	8	37487	37494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017545	CAA	2	6	38707	38712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017545	AGG	2	6	44603	44608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017545	TCT	2	6	44619	44624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017545	A	7	7	44689	44695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017545	AAT	2	6	44711	44716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017545	ATG	2	6	44729	44734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017545	AAAT	2	8	44782	44789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017545	AGG	2	6	45844	45849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017545	AGA	2	6	45850	45855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017545	C	6	6	45875	45880	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_017545	AGG	2	6	49411	49416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017545	ATAA	2	8	51345	51352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017545	GACTT	2	10	51374	51383	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017545	TAAA	2	8	51407	51414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017545	AGTG	2	8	51424	51431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017545	T	8	8	52105	52112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017545	TC	3	6	52126	52131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017545	TTAG	2	8	52158	52165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017545	TTG	2	6	53458	53463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017545	ATA	2	6	53541	53546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017545	ATT	2	6	53568	53573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017545	GCTC	2	8	53578	53585	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017545	ATGGT	2	10	53628	53637	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017545	AGG	2	6	53670	53675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017545	GAG	2	6	54018	54023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017545	AGG	2	6	54601	54606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017545	T	6	6	54891	54896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017545	AAG	2	6	54935	54940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017545	TATT	2	8	54952	54959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017545	TA	3	6	54971	54976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017545	A	7	7	54982	54988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017545	T	8	8	55661	55668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017545	TAAA	2	8	55684	55691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017545	TAT	2	6	55715	55720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017545	A	6	6	55761	55766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017545	T	6	6	55782	55787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017545	TTA	2	6	55830	55835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017545	TAAAA	2	10	56667	56676	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017545	GGA	2	6	56720	56725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017545	T	7	7	58793	58799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017545	CCATG	2	10	58803	58812	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017545	TGA	2	6	58821	58826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017545	ATA	2	6	58847	58852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017545	TGA	2	6	58854	58859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017545	GTTA	2	8	58863	58870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017545	A	7	7	58917	58923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017545	AAT	2	6	64294	64299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017545	ATA	2	6	64585	64590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017545	CAA	2	6	64904	64909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017545	CATA	2	8	64919	64926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017545	T	6	6	64963	64968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017545	TA	3	6	65015	65020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017545	A	6	6	65020	65025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017545	A	7	7	69030	69036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017545	AGG	2	6	75262	75267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017545	AGG	2	6	77333	77338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017545	TAG	2	6	77904	77909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017545	GAA	2	6	77953	77958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017545	GAT	2	6	77959	77964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017545	AAT	2	6	78042	78047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017545	ATT	2	6	79006	79011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017545	ACA	2	6	79038	79043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017545	CTTA	2	8	79075	79082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017545	ATT	2	6	79089	79094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017545	A	6	6	79115	79120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017545	TAT	2	6	79127	79132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017545	GTG	2	6	79148	79153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017545	TAA	2	6	79185	79190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017545	AAATA	2	10	79222	79231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017545	AT	4	8	79262	79269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017545	GA	3	6	79274	79279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017545	ATGG	2	8	79307	79314	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017545	GAG	2	6	79324	79329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017545	T	6	6	79334	79339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017545	AAG	2	6	79376	79381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017545	ACA	2	6	79487	79492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017545	AG	3	6	79501	79506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017545	ACTA	2	8	79514	79521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017545	AGT	2	6	79534	79539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017545	GA	3	6	79551	79556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017545	TACA	2	8	79595	79602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017545	A	6	6	79619	79624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017545	T	6	6	79635	79640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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